因大公司的崗位內控管理較嚴格，現以小公司為例，來分析人員較少的情況下怎樣把不能相容的印章分開管理。設想一下，如若是小公司，那么按照以上規定，公章、財務章、法人章、合同章、發票章均在財務部，如果任意大股東要求財務部員工加蓋，會產生什么樣的效果，抑或是財務部員工內部勾結又會有什么后果。因此，小公司應該靈活處理，把不能相容的印章分開管理，需要注意的如下：

1.票據的開具

開具票據需要財務章、法人章以及票據。因此，財務章應交于管理法人章外另一關鍵管理人員持有，票據第三人管理。

2.合同效力

合同力需要合同章與法人章。因此合同章交于管理法人章外另一關鍵管理人員持有。

3.公章的效力

是否應該與法人章持有人分開管理？在公章代替合同章時，應該分開管理，合同法規定，公章與合同章有同等法律效力。如一個公司即有合同章又有公章時，蓋具了公章的合同是否生效？為防范法人濫用權利，應該分開管理，并且在合同條款中嚴格規定合同的效力在加蓋了合同章或公章及法人章后生效，這樣即有法人及合同章或公章持有者雙重確認后加蓋。因此，公章除外部事務處理外也具有合同效力行為，因此，應視同合同專用章管理。

4.失職責任

公司重要的事務無非是人，財，物。在印章的使用時，應慎重考慮是否加蓋印章，是否導致公司的人財物流失。其中更重要的環節是企業管理的流程，例如合同的審批流程，票據的使用流程等，嚴格公司的管理流程，加蓋印鑒的流程，減少公司的權益損失。