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發票缺聯如何處理？

根據《國家稅務總局關于金稅工程增值稅征管信息系統發現的涉嫌違規增值稅專用發票處理問題的通知 》國稅函〔2006〕969號第二條規定："關于增值稅專用發票稽核系統發現涉嫌違規發票的處理 目前，增值稅專用發票稽核系統發現涉嫌違規發票分"比對不符"、"缺聯"和"作廢"等類型。

凡屬于上述涉嫌違規的發票，暫不得作為增值稅進項稅額的抵扣憑證，由管理部門按照審核檢查的有關規定進行核查，并按有關規定進行處理。

經稅務機關檢查確認屬于稅務機關責任以及技術性錯誤造成的，允許作為增值稅進項稅額的抵扣憑證;不屬于稅務機關責任以及技術性錯誤造成的，不得作為增值稅進項稅額的抵扣憑證。屬于稅務機關責任的，由稅務機關誤操作的相關部門核實后，區縣級稅務機關出具書面證明;屬于技術性錯誤的，由稅務機關技術主管部門核實后，區縣級稅務機關出具書面證明。"

所謂缺聯，即缺少聯次，這種情況在進行比對的發票中常會出現，出現最多的就是運輸發票，缺聯實際上就是指的缺少銷售方的記賬聯，即缺少銷項，因為通常情況下發票開具后，開票方的開票數據就會記載在金稅卡中，在次月的稅額申報時，就會將開票的數據copy到國家稅務總局的的總數據庫中。在這要說的是發票認證的原理，發票認證時并不是說對方的銷項信息完全和你的抵扣聯一致才能認證，抵扣聯認證的關鍵在84位密文，這84位密文是根據你的銷售方稅號、購貨方稅號、購貨日期、金額、稅額等信息組成的，即一臺稅控機都有一個固定的密文不變，一旦開出的發票符合以上特征的話，就可以拿去認證，并能通過。之所以你的發票在07年12月收到并抵扣，但在08年3月通知你發票不能抵扣，是缺聯發票，是因為大家都知道發票的抵扣期限是90天，在這期間以后，稅務總局的系統會根據每一張抵扣聯去比對相應的銷售聯，以確保沒有假票或錯票，因為發現你有抵扣，但是沒有對方單位相應的銷售，所以這張票上的稅額就不能抵扣。本人分析出現這種問題的原因主要是對方將該票開出，你公司進行抵扣完畢后，對方又將該銷項發票在稅控系統中作廢造成的。

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