我們知道，如果是一般納稅人在抵扣進(jìn)項(xiàng)稅的時(shí)候多數(shù)情況下，是依據(jù)增值稅的專用發(fā)票，按照發(fā)票上的稅額來(lái)抵扣。

比如一般納稅人企業(yè)采購(gòu)貨物時(shí)，通常情況下可以抵扣的稅率為13%，而很多農(nóng)產(chǎn)品適用的稅率為9%，這是因?yàn)檫@些農(nóng)產(chǎn)品基本上都屬于低稅率的產(chǎn)品。

在增值稅暫行條例中，對(duì)這些貨物所適用的稅率為低稅率：

1.糧食等農(nóng)產(chǎn)品、食用植物油、食用鹽；

2.自來(lái)水、暖氣、冷氣、熱水、煤氣、石油液化氣、天然氣、二甲醚、沼氣、居民用煤炭制品；

3.圖書(shū)、報(bào)紙、雜志、音像制品、電子出版物；

4.飼料、化肥、農(nóng)藥、農(nóng)機(jī)、農(nóng)膜；5.國(guó)務(wù)院規(guī)定的其他貨物。

因此，一般納稅人的企業(yè)在采購(gòu)農(nóng)產(chǎn)品時(shí)，可以抵扣進(jìn)項(xiàng)稅的稅率就是9%。

具體是哪些票據(jù)呢？

1、一般納稅人開(kāi)具的專用發(fā)票

取得一般納稅人開(kāi)具的增值稅專用發(fā)票，所抵扣的就是發(fā)票上注明的增值稅額為進(jìn)項(xiàng)稅額。

這種情況下，企業(yè)所采購(gòu)的上游單位一定是增值稅一般納稅人，同時(shí)，對(duì)方如果屬于可以享受農(nóng)產(chǎn)品銷售的免征增值稅的優(yōu)惠，必須要放棄免稅才可開(kāi)具稅率為9%的專用發(fā)票。

2、海關(guān)進(jìn)口專用繳款書(shū)

企業(yè)從國(guó)外進(jìn)口農(nóng)產(chǎn)品，所取得的海關(guān)進(jìn)口增值稅專用繳款書(shū)上注明的增值稅額為進(jìn)項(xiàng)稅額。所抵扣的進(jìn)項(xiàng)稅額就是進(jìn)口環(huán)節(jié)的增值稅額。

3、小規(guī)模納稅人開(kāi)具的專用發(fā)票

企業(yè)如果從小規(guī)模納稅人那里采購(gòu)農(nóng)產(chǎn)品，所取得的發(fā)票就是按照簡(jiǎn)易計(jì)稅方法依照3%征收率的增值稅專用發(fā)票，此時(shí)以增值稅專用發(fā)票上注明的金額（不含稅）和9%的扣除率計(jì)算進(jìn)項(xiàng)稅額。

由于目前小規(guī)模納稅人適用3%征收率的項(xiàng)目是可以享受免征增值稅的優(yōu)惠，因此企業(yè)想要抵扣進(jìn)項(xiàng)稅，需要該小規(guī)模納稅人放棄免稅，開(kāi)具3%征收率的專用發(fā)票，當(dāng)然這種情況下，小規(guī)模納稅人是需要按照3%征收率來(lái)繳納增值稅，由于增值稅是間接稅的特點(diǎn)，這個(gè)稅款實(shí)際上也是由購(gòu)買(mǎi)方來(lái)承擔(dān)的。

當(dāng)然了，按照3%交稅，按照9%來(lái)抵扣，對(duì)于采購(gòu)方來(lái)說(shuō)一定是劃算的。

需要提示的是，小規(guī)模納稅人開(kāi)具的普通發(fā)票是不可以計(jì)算抵扣進(jìn)項(xiàng)稅的。

4、農(nóng)產(chǎn)品銷售發(fā)票

這種農(nóng)產(chǎn)品銷售發(fā)票就是普通發(fā)票，常見(jiàn)的是增值稅電子普通發(fā)票，上面會(huì)寫(xiě)著的免稅字樣，這是由于農(nóng)業(yè)生產(chǎn)者所銷售的自產(chǎn)自銷的農(nóng)產(chǎn)品屬于增值稅的免稅范圍。

企業(yè)取得這類發(fā)票可以抵扣的進(jìn)項(xiàng)稅額為發(fā)票金額的9%，屬于計(jì)算抵扣的方式。

5、農(nóng)產(chǎn)品收購(gòu)發(fā)票

這類發(fā)票是極為特殊的，它是由購(gòu)買(mǎi)方在向農(nóng)業(yè)生產(chǎn)者采購(gòu)農(nóng)產(chǎn)品時(shí)自行開(kāi)具，也稱為自開(kāi)票，目前均以普通發(fā)票的形式存在，上面會(huì)寫(xiě)收購(gòu)字樣，常見(jiàn)的就是帶有收購(gòu)字樣的農(nóng)產(chǎn)品增值稅電子普通發(fā)票。#農(nóng)產(chǎn)品

企業(yè)取得這類發(fā)票可以抵扣的進(jìn)項(xiàng)稅額為收購(gòu)發(fā)票上注明的農(nóng)產(chǎn)品買(mǎi)價(jià)和9%的扣除率計(jì)算進(jìn)項(xiàng)稅額，同樣屬于計(jì)算抵扣的方式。

6、加計(jì)抵扣

企業(yè)購(gòu)進(jìn)用于生產(chǎn)或者委托加工13%稅率貨物的農(nóng)產(chǎn)品，可以在生產(chǎn)領(lǐng)用環(huán)節(jié)加計(jì)扣除1%。

也就是對(duì)農(nóng)產(chǎn)品進(jìn)行深加工了，在以上的幾種抵扣進(jìn)項(xiàng)稅之后，再多抵扣進(jìn)項(xiàng)稅的方式，這種計(jì)算抵扣則不需要發(fā)票，是直接計(jì)算抵扣，該進(jìn)項(xiàng)稅額需要從產(chǎn)品的成本中扣除。

為了更好地理解哪些屬于農(nóng)產(chǎn)品的深加工，我們要知道農(nóng)產(chǎn)品的初加工，在財(cái)稅【2008】149號(hào)中有詳細(xì)的列示，比如這些加工過(guò)程：清洗、分割、脫水、干燥、發(fā)酵、分級(jí)、包裝等，對(duì)農(nóng)產(chǎn)品的性狀沒(méi)有進(jìn)行改變。如果是深加工，比如，將肉做成了罐頭、將鴨蛋腌制了、將鮮奶做成了酸奶等。

最后需要提示的是：如果農(nóng)產(chǎn)品為核定扣除，則不再憑扣稅憑證直接抵扣增值稅進(jìn)項(xiàng)稅額。